叶绿素是植物光合作用吸收和传递光能的最主要色素,叶绿素的生物合成途径由一系列酶促反应完成。镁螯合酶催化原卟啉与镁离子结合,生成镁原卟啉,这是叶绿素分支途径的第一步反应,是一步耗能反应。镁螯合酶由三个亚基组成:含有活性中心的催化亚基ChlH和两个AAA家族的亚基——ChlI和ChlD。ChlI具有ATP酶活性、提供反应所需的能量,并与ChlD形成双层六聚体结构。催化亚基ChlH的主要状态是单体,分子量约为150 kDa。电镜结构显示,ChlH的结构是一个不规则的笼状,然而由于分辨率不高,其活性中心的结构信息仍然缺乏。
中科院植物研究所与中国科学技术大学科研人员合作,解析了光合蓝细菌集胞藻ChlH的2.5 Å分辨率结构,发现它可以分为6个结构域,形似一个沙槌。蛋白N端的两个结构域构成槌柄,其余4个结构域构成一个大致球形的槌头。在第3和第5个结构域之间,包含了一个能够容纳原卟啉的空腔。研究人员通过对各类光合生物的ChlH氨基酸序列进行比对,发现构成这一空腔的氨基酸非常保守,推测它就是镁螯合酶的活性中心。位于第3个与第5个结构域之间的一个丙氨酸的缬氨酸突变体对应于拟南芥的“基因组解偶联”表型5(genomes uncoupled 5, GUN5)的突变,因此ChlH也被称作GUN5。研究人员推测该突变造成第3个与第5个结构域之间的阻碍,导致酶的活性降低。集胞藻ChlH/GUN5的结构是第一个高分辨率的镁螯合酶催化亚基结构,为深入研究这样一个复杂的酶的催化机理打下了基础。该进展发表于2015年第9期的《自然-植物》(Nature Plants)。
镁螯合酶的底物原卟啉和产物镁原卟啉均可被GUN4蛋白结合。已有的GUN4结构由于没有结合卟啉,不能确切地描述卟啉的结合方式。刘琳研究组获得了集胞藻GUN4结合次卟啉(原卟啉的类似物)的1.5 Å分辨率结构以及结合镁次卟啉的2.0 Å结构,发现GUN4以一种半开放型的方式结合卟啉,有利于卟啉分子的传递。该进展作为封面文章发表于2015年第7期的《分子植物》(Molecular Plant)。研究组另一项工作发现,镁原卟啉上第13位丙酸侧链的羧基甲基化由镁原卟啉甲基转移酶ChlM(叶绿素分支途径的第二个酶)催化,研究得到的集胞藻ChlM与甲基供体SAM的复合物结构揭示了参与催化的关键氨基酸残基。该进展发表于2014年第37期的《生物化学杂志》(The Journal of Biological Chemistry)。
文章连接:
http://www.nature.com/articles/nplants2015125
http://www.cell.com/molecular-plant/abstract/S1674-2052(15)00234-8
http://www.jbc.org/content/289/37/25690.long