DNA序列差异的鉴定是解析重要生物学性状的基础。武汉植物园科研人员对30份苹果种质资源进行了简化基因组测序，获得39,635个均匀分布在苹果染色体上的单碱基多态性位点（SNPs）。 

    基于这些SNPs的遗传学研究结果表明：苹果野生种的遗传多样性显著高于栽培苹果，且栽培品种和野生种之间存在着双向的基因流；栽培苹果及其野生种连锁不平衡（LD）衰减均非常快，关联分析能实现苹果基因的精细定位；栽培苹果与苹果野生种连锁不平衡区域（LD block）分别不同，且栽培苹果多数LD block位于果实品质性状QTL区间内，揭示了果实品质在苹果驯化过程中受到了选择。